Em 1943, o Eng. Antonio de Carvalho Aguiar, fundador do Colégio Bandeirantes, contratou o Dr. Clemente Pereira para coordenar o Laboratório de Biologia. Desde o início, direção e coordenação acreditavam que o ensino-aprendizagem deveria ter uma abordagem experimental para facilitar a compreensão dos fenômenos físicos, químicos e biológicos.

Ao longo destas seis décadas, o Colégio Bandeirantes vem "mudando com as mudanças" sociais, econômicas, culturais e tecnológicas sem perder a tradição.

"Um experimento é uma pergunta que se faz à natureza (Galileu Galilei)" e ajuda a ter uma visão concreta dos fenômenos abstratos deste mundo, induz ao raciocínio e promove o espírito crítico.

As aulas experimentais de Ciências e Biologia fazem parte do currículo das quatro séries do Ensino Fundamental e das três séries do Ensino Médio, com uma aula por semana, que se realiza em quatro amplos laboratórios, sendo um deles adaptado para crianças de 5.a e 6.a séries. Há também uma quinta sala para ensaios biológicos e reuniões de professores.

O Laboratório de Biologia conta com 75 microscópios, 45 lupas binoculares, 5 computadores com multimídia, peças anatômicas formolizadas e em resina plástica, vários kits para os mais diversos experimentos, sais, corantes, reagentes, 3 microretroprojetores, laminário completo de histologia animal e vegetal, 3 vídeodisc laser,e 4 televisores e 27 "laptops" que apresentam os roteiros das aulas e oferecem facilidade de pesquisas, ilustrações dos experimentos e exercícios para casa.